冷冻式干燥机应安装在环境温度为2-45℃，四周通风良好，空气洁净的建筑物内；特别是避免空气中含有腐蚀类成份（如氨）。当室内机房通风条件不良时，需在机房内安装换气排风设备。
冷干机与空压机之间至少有4-5米的距离，以防止空压机产生的振动影响冷干机正常运行。
风冷型冷干机的进风口与墙体距离1.5m以上，两台干燥机的进风口与排风口不能面对面。冷干机四周应留有一定的空间，以方便维修和日常维护。
真空冷冻干燥机的详细使用方法如下：
一：标准型
1)将样品放入料盘中，然后将料盘放入冻干架中，放置并固定样品温度传感器，将冻干架放入冷阱中，盖上保温盖进行预冻，预冻至样品完全冻结并保存一段时间。
2)从冷阱中取出预冻材料托盘和冻干架，将支撑托盘放在冷阱口上方，将冻干架放在支撑托盘上，用玻璃罩盖住。
3)拧紧充气阀，点击屏幕上的“真空表”按钮，屏幕显示真空度为110kpa，然后点击“真空泵”按钮启动真空泵。真空度迅速下降，小于等于10Pa为正常。
他们的区别是冷干机是通过冷媒压缩机冷凝水蒸气，之后再将空气回温来达到降低相对湿度的目的；过滤器是通过滤芯精密的空间网状结构滤除固体尘埃和液体的水分、油滴颗粒。水冷式超低温真空冷冻干燥机对环境温度不敏感，不过它对冷却水的要求更高，但水冷式的安装较风冷式复杂；冷冻干燥就是将含水物质，先冻结成固态，而后使其中的水分从固态升华成气态，以除去水分而保存物质的方法。
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