空气先经预冷器降温除去一部分水，再经蒸发器大幅度降温除去大量的水，通过挡水板或汽水分离器把冷凝水排到隔污桶，再经排水器排出。
制冷原理与换热原理
制冷原理：系统工作时，压缩机将蒸发器所产生的低压低温制冷剂蒸汽吸入汽缸内，经压缩后压力升高(温度也升高)到稍大于冷凝器内的压力时，将高压制冷剂蒸汽排到冷凝器中。所以压缩机起着压缩和输送制冷剂蒸汽的作用。
水冷式超低温真空冷冻干燥机对环境温度不敏感，不过它对冷却水的要求更高，但水冷式的安装较风冷式复杂；冻干机起源于19世纪20年代的真空冷冻干燥技术经历了几十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了长足进展。主机与真空泵之间由真空管连接，连接处采用卡箍。卡箍内含一只密封橡胶圈，连接前可在橡胶圈上涂抹适量真空脂，再用卡箍卡紧。
首先压缩机出来的空气温度到冷干机的时候，根据季节的不同在40—50度之间，这个时候的含水份等比较多！进入21世纪，真空冻干技术凭借其它干燥方法无法比拟的优点，越来越受到人们的青睐，除了在、生物制品、食品、血液制品、活性物质领域得到广泛应用。压缩空气的温度降至0℃-8℃，空气中的水份在此温度下析出，通过冷凝器将压缩空气中冷凝出的水分油和杂质分离，通过自动排水器将其排出机外。
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